Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Kif4P33174 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Kif4P33174 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Kif4P33174 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Kif4P33174 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Kif4P33174 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Kif4P33174 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Kif4P33174 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Kif4P33174 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Kif4P33174 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Kif4P33174 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Kif4P33174 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Kif4P33174 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Kif4P33174 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Kif4P33174 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Kif4P33174 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Kif4P33174 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Kif4P33174 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Kif4P33174 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Kif4P33174 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Kif4P33174 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Kif4P33174 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Kif4P33174 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Kif4P33174 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Kif4P33174 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Kif4P33174 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Kif4P33174 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
Kif4P33174 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Kif4P33174 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Kif4P33174 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Kif4P33174 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Kif4P33174 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Kif4P33174 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Kif4P33174 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Kif4P33174 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Kif4P33174 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Kif4P33174 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Kif4P33174 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Kif4P33174 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Kif4P33174 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Kif4P33174 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Kif4P33174 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Kif4P33174 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Kif4P33174 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Kif4P33174 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Kif4P33174 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Kif4P33174 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Kif4P33174 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Kif4P33174 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Kif4P33174 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Kif4P33174 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Kif4P33174 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Kif4P33174 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Kif4P33174 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Kif4P33174 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Kif4P33174 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Kif4P33174 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Kif4P33174 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Kif4P33174 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Kif4P33174 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Kif4P33174 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Kif4P33174 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Kif4P33174 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Kif4P33174 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Kif4P33174 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Kif4P33174 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Kif4P33174 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Kif4P33174 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Kif4P33174 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Kif4P33174 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Kif4P33174 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Kif4P33174 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Kif4P33174 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Kif4P33174 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Kif4P33174 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Kif4P33174 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Kif4P33174 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms