Protein–RNA interactions for Protein: P31725

S100a9, Protein S100-A9, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100a9P31725 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
S100a9P31725 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
S100a9P31725 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
S100a9P31725 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
S100a9P31725 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
S100a9P31725 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
S100a9P31725 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
S100a9P31725 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
S100a9P31725 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
S100a9P31725 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
S100a9P31725 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
S100a9P31725 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
S100a9P31725 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100a9P31725 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100a9P31725 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S100a9P31725 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
S100a9P31725 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S100a9P31725 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S100a9P31725 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S100a9P31725 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S100a9P31725 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S100a9P31725 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S100a9P31725 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
S100a9P31725 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
S100a9P31725 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
S100a9P31725 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S100a9P31725 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
S100a9P31725 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
S100a9P31725 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
S100a9P31725 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
S100a9P31725 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S100a9P31725 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
S100a9P31725 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S100a9P31725 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S100a9P31725 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S100a9P31725 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S100a9P31725 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
S100a9P31725 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
S100a9P31725 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S100a9P31725 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S100a9P31725 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S100a9P31725 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S100a9P31725 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
S100a9P31725 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
S100a9P31725 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
S100a9P31725 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
S100a9P31725 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
S100a9P31725 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
S100a9P31725 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
S100a9P31725 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
S100a9P31725 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
S100a9P31725 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
S100a9P31725 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
S100a9P31725 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100a9P31725 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
S100a9P31725 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S100a9P31725 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S100a9P31725 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100a9P31725 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S100a9P31725 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100a9P31725 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100a9P31725 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100a9P31725 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S100a9P31725 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
S100a9P31725 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100a9P31725 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
S100a9P31725 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100a9P31725 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100a9P31725 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
S100a9P31725 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
S100a9P31725 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
S100a9P31725 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms