Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
Fkbp4P30416 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Fkbp4P30416 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Fkbp4P30416 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Fkbp4P30416 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Fkbp4P30416 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Fkbp4P30416 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Fkbp4P30416 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Fkbp4P30416 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Fkbp4P30416 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Fkbp4P30416 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Fkbp4P30416 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Fkbp4P30416 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Fkbp4P30416 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Fkbp4P30416 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Fkbp4P30416 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Fkbp4P30416 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Fkbp4P30416 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Fkbp4P30416 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Fkbp4P30416 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Fkbp4P30416 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Fkbp4P30416 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Fkbp4P30416 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Fkbp4P30416 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Fkbp4P30416 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Fkbp4P30416 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Fkbp4P30416 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Fkbp4P30416 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Fkbp4P30416 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Fkbp4P30416 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Fkbp4P30416 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Fkbp4P30416 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Fkbp4P30416 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Fkbp4P30416 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Fkbp4P30416 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Fkbp4P30416 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Fkbp4P30416 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Fkbp4P30416 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Fkbp4P30416 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Fkbp4P30416 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Fkbp4P30416 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Fkbp4P30416 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,82■■■■□ 3,16
Fkbp4P30416 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Fkbp4P30416 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Fkbp4P30416 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Fkbp4P30416 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Fkbp4P30416 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Fkbp4P30416 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Fkbp4P30416 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Fkbp4P30416 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Fkbp4P30416 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Fkbp4P30416 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Fkbp4P30416 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Fkbp4P30416 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,64■■■■□ 3,14
Fkbp4P30416 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Fkbp4P30416 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Fkbp4P30416 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Fkbp4P30416 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Fkbp4P30416 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Fkbp4P30416 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Fkbp4P30416 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Fkbp4P30416 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Fkbp4P30416 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Fkbp4P30416 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Fkbp4P30416 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Fkbp4P30416 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Fkbp4P30416 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Fkbp4P30416 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Fkbp4P30416 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Fkbp4P30416 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Fkbp4P30416 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Fkbp4P30416 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Fkbp4P30416 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Fkbp4P30416 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Fkbp4P30416 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Fkbp4P30416 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Fkbp4P30416 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Fkbp4P30416 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Fkbp4P30416 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Fkbp4P30416 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Fkbp4P30416 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Fkbp4P30416 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Fkbp4P30416 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Fkbp4P30416 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Fkbp4P30416 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Fkbp4P30416 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Fkbp4P30416 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Fkbp4P30416 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Fkbp4P30416 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Fkbp4P30416 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Fkbp4P30416 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Fkbp4P30416 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms