Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Kif3aP28741 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Kif3aP28741 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Kif3aP28741 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Kif3aP28741 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Kif3aP28741 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Kif3aP28741 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Kif3aP28741 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Kif3aP28741 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Kif3aP28741 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Kif3aP28741 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Kif3aP28741 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Kif3aP28741 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kif3aP28741 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Kif3aP28741 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Kif3aP28741 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Kif3aP28741 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Kif3aP28741 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Kif3aP28741 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Kif3aP28741 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Kif3aP28741 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Kif3aP28741 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Kif3aP28741 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Kif3aP28741 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kif3aP28741 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kif3aP28741 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Kif3aP28741 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Kif3aP28741 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kif3aP28741 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Kif3aP28741 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kif3aP28741 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kif3aP28741 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kif3aP28741 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Kif3aP28741 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kif3aP28741 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kif3aP28741 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kif3aP28741 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Kif3aP28741 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kif3aP28741 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Kif3aP28741 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Kif3aP28741 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Kif3aP28741 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Kif3aP28741 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Kif3aP28741 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kif3aP28741 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kif3aP28741 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kif3aP28741 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kif3aP28741 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kif3aP28741 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kif3aP28741 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Kif3aP28741 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kif3aP28741 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Kif3aP28741 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Kif3aP28741 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Kif3aP28741 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Kif3aP28741 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Kif3aP28741 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kif3aP28741 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kif3aP28741 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kif3aP28741 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kif3aP28741 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kif3aP28741 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Kif3aP28741 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kif3aP28741 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kif3aP28741 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kif3aP28741 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kif3aP28741 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kif3aP28741 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kif3aP28741 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kif3aP28741 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kif3aP28741 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kif3aP28741 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Kif3aP28741 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
Kif3aP28741 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kif3aP28741 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kif3aP28741 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kif3aP28741 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kif3aP28741 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kif3aP28741 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms