Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RxrgP28705 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RxrgP28705 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RxrgP28705 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RxrgP28705 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RxrgP28705 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RxrgP28705 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RxrgP28705 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RxrgP28705 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RxrgP28705 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RxrgP28705 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RxrgP28705 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RxrgP28705 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RxrgP28705 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RxrgP28705 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RxrgP28705 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RxrgP28705 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RxrgP28705 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RxrgP28705 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RxrgP28705 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RxrgP28705 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RxrgP28705 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RxrgP28705 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RxrgP28705 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RxrgP28705 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RxrgP28705 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RxrgP28705 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RxrgP28705 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RxrgP28705 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RxrgP28705 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RxrgP28705 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RxrgP28705 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RxrgP28705 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RxrgP28705 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RxrgP28705 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RxrgP28705 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RxrgP28705 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RxrgP28705 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RxrgP28705 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RxrgP28705 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RxrgP28705 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RxrgP28705 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RxrgP28705 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RxrgP28705 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RxrgP28705 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RxrgP28705 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RxrgP28705 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RxrgP28705 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RxrgP28705 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RxrgP28705 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RxrgP28705 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RxrgP28705 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RxrgP28705 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RxrgP28705 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RxrgP28705 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RxrgP28705 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RxrgP28705 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RxrgP28705 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RxrgP28705 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RxrgP28705 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RxrgP28705 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RxrgP28705 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RxrgP28705 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RxrgP28705 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RxrgP28705 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RxrgP28705 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RxrgP28705 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RxrgP28705 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RxrgP28705 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RxrgP28705 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RxrgP28705 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RxrgP28705 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RxrgP28705 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RxrgP28705 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RxrgP28705 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RxrgP28705 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RxrgP28705 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RxrgP28705 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RxrgP28705 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RxrgP28705 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RxrgP28705 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RxrgP28705 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RxrgP28705 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RxrgP28705 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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