Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
RxrgP28705 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
RxrgP28705 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
RxrgP28705 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
RxrgP28705 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
RxrgP28705 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
RxrgP28705 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
RxrgP28705 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
RxrgP28705 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
RxrgP28705 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
RxrgP28705 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
RxrgP28705 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
RxrgP28705 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
RxrgP28705 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
RxrgP28705 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
RxrgP28705 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
RxrgP28705 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
RxrgP28705 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
RxrgP28705 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
RxrgP28705 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
RxrgP28705 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
RxrgP28705 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
RxrgP28705 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
RxrgP28705 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
RxrgP28705 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
RxrgP28705 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
RxrgP28705 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
RxrgP28705 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
RxrgP28705 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
RxrgP28705 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
RxrgP28705 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
RxrgP28705 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
RxrgP28705 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
RxrgP28705 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
RxrgP28705 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
RxrgP28705 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
RxrgP28705 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
RxrgP28705 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,89
RxrgP28705 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
RxrgP28705 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
RxrgP28705 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
RxrgP28705 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,73■■□□□ 1,87
RxrgP28705 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
RxrgP28705 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
RxrgP28705 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
RxrgP28705 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
RxrgP28705 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
RxrgP28705 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,61■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
RxrgP28705 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
RxrgP28705 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
RxrgP28705 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
RxrgP28705 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
RxrgP28705 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
RxrgP28705 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
RxrgP28705 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
RxrgP28705 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
RxrgP28705 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
RxrgP28705 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
RxrgP28705 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
RxrgP28705 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
RxrgP28705 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
RxrgP28705 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
RxrgP28705 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
RxrgP28705 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
RxrgP28705 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
RxrgP28705 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
RxrgP28705 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
RxrgP28705 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
RxrgP28705 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
RxrgP28705 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
RxrgP28705 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,27■■□□□ 1,8
RxrgP28705 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,21■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,2■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
RxrgP28705 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
RxrgP28705 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
RxrgP28705 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
RxrgP28705 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
RxrgP28705 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
RxrgP28705 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
RxrgP28705 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
RxrgP28705 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
RxrgP28705 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
RxrgP28705 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
RxrgP28705 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
RxrgP28705 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
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