Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RxrbP28704 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RxrbP28704 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RxrbP28704 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RxrbP28704 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RxrbP28704 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RxrbP28704 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RxrbP28704 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RxrbP28704 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RxrbP28704 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RxrbP28704 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RxrbP28704 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RxrbP28704 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RxrbP28704 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RxrbP28704 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RxrbP28704 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RxrbP28704 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RxrbP28704 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RxrbP28704 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RxrbP28704 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RxrbP28704 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RxrbP28704 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RxrbP28704 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RxrbP28704 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RxrbP28704 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RxrbP28704 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RxrbP28704 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RxrbP28704 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RxrbP28704 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RxrbP28704 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RxrbP28704 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RxrbP28704 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RxrbP28704 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RxrbP28704 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RxrbP28704 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RxrbP28704 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RxrbP28704 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RxrbP28704 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RxrbP28704 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RxrbP28704 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RxrbP28704 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RxrbP28704 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RxrbP28704 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RxrbP28704 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RxrbP28704 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RxrbP28704 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RxrbP28704 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RxrbP28704 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RxrbP28704 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RxrbP28704 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RxrbP28704 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RxrbP28704 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RxrbP28704 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RxrbP28704 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RxrbP28704 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RxrbP28704 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RxrbP28704 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RxrbP28704 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RxrbP28704 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RxrbP28704 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RxrbP28704 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RxrbP28704 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RxrbP28704 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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