Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Atxn10P28658 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Atxn10P28658 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Atxn10P28658 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Atxn10P28658 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Atxn10P28658 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Atxn10P28658 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Atxn10P28658 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Atxn10P28658 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Atxn10P28658 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Atxn10P28658 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Atxn10P28658 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Atxn10P28658 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Atxn10P28658 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Atxn10P28658 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Atxn10P28658 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Atxn10P28658 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Atxn10P28658 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Atxn10P28658 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Atxn10P28658 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Atxn10P28658 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Atxn10P28658 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Atxn10P28658 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Atxn10P28658 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Atxn10P28658 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Atxn10P28658 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Atxn10P28658 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Atxn10P28658 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Atxn10P28658 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Atxn10P28658 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Atxn10P28658 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Atxn10P28658 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Atxn10P28658 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Atxn10P28658 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Atxn10P28658 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Atxn10P28658 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Atxn10P28658 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Atxn10P28658 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Atxn10P28658 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Atxn10P28658 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Atxn10P28658 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Atxn10P28658 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Atxn10P28658 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Atxn10P28658 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Atxn10P28658 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Atxn10P28658 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Atxn10P28658 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Atxn10P28658 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Atxn10P28658 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Atxn10P28658 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Atxn10P28658 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Atxn10P28658 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atxn10P28658 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Atxn10P28658 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Atxn10P28658 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Atxn10P28658 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Atxn10P28658 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Atxn10P28658 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Atxn10P28658 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Atxn10P28658 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Atxn10P28658 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,88
Atxn10P28658 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Atxn10P28658 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Atxn10P28658 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Atxn10P28658 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Atxn10P28658 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Atxn10P28658 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Atxn10P28658 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Atxn10P28658 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,4 ms