Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Gja4P28235 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Gja4P28235 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gja4P28235 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Gja4P28235 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Gja4P28235 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gja4P28235 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gja4P28235 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gja4P28235 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gja4P28235 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gja4P28235 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Gja4P28235 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gja4P28235 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gja4P28235 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gja4P28235 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gja4P28235 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gja4P28235 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Gja4P28235 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gja4P28235 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gja4P28235 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gja4P28235 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gja4P28235 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gja4P28235 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gja4P28235 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gja4P28235 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gja4P28235 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gja4P28235 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gja4P28235 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Gja4P28235 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gja4P28235 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gja4P28235 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gja4P28235 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gja4P28235 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Gja4P28235 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gja4P28235 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Gja4P28235 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gja4P28235 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gja4P28235 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Gja4P28235 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Gja4P28235 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Gja4P28235 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Gja4P28235 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Gja4P28235 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gja4P28235 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Gja4P28235 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Gja4P28235 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Gja4P28235 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Gja4P28235 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Gja4P28235 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Gja4P28235 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Gja4P28235 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Gja4P28235 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Gja4P28235 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Gja4P28235 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Gja4P28235 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Gja4P28235 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Gja4P28235 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Gja4P28235 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Gja4P28235 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Gja4P28235 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Gja4P28235 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Gja4P28235 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Gja4P28235 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Gja4P28235 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Gja4P28235 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Gja4P28235 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Gja4P28235 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Gja4P28235 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Gja4P28235 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gja4P28235 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Gja4P28235 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Gja4P28235 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Gja4P28235 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Gja4P28235 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,2■■□□□ 1,95
Gja4P28235 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Gja4P28235 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gja4P28235 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gja4P28235 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Gja4P28235 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Gja4P28235 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Gja4P28235 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Gja4P28235 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,9 ms