Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gja1P23242 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja1P23242 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gja1P23242 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja1P23242 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja1P23242 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja1P23242 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja1P23242 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gja1P23242 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja1P23242 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gja1P23242 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja1P23242 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gja1P23242 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja1P23242 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja1P23242 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gja1P23242 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja1P23242 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja1P23242 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja1P23242 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja1P23242 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja1P23242 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gja1P23242 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja1P23242 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gja1P23242 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gja1P23242 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gja1P23242 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja1P23242 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja1P23242 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gja1P23242 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gja1P23242 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja1P23242 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja1P23242 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja1P23242 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja1P23242 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja1P23242 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja1P23242 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja1P23242 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja1P23242 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gja1P23242 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja1P23242 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gja1P23242 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja1P23242 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja1P23242 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja1P23242 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja1P23242 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja1P23242 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja1P23242 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja1P23242 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja1P23242 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja1P23242 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gja1P23242 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja1P23242 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja1P23242 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja1P23242 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja1P23242 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja1P23242 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja1P23242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja1P23242 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja1P23242 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja1P23242 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja1P23242 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gja1P23242 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja1P23242 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja1P23242 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja1P23242 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gja1P23242 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gja1P23242 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja1P23242 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja1P23242 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja1P23242 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja1P23242 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja1P23242 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja1P23242 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja1P23242 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja1P23242 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja1P23242 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja1P23242 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja1P23242 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja1P23242 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja1P23242 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja1P23242 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja1P23242 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gja1P23242 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja1P23242 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gja1P23242 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gja1P23242 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gja1P23242 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja1P23242 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja1P23242 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja1P23242 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja1P23242 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gja1P23242 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms