Protein–RNA interactions for Protein: P22389

Edn2, Endothelin-2, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn2P22389 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,17■■□□□ 1,14
Edn2P22389 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Edn2P22389 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Edn2P22389 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Edn2P22389 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Edn2P22389 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Edn2P22389 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Edn2P22389 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Edn2P22389 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Edn2P22389 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Edn2P22389 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Edn2P22389 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Edn2P22389 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Edn2P22389 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Edn2P22389 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Edn2P22389 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Edn2P22389 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Edn2P22389 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Edn2P22389 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Edn2P22389 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Edn2P22389 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Edn2P22389 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
Edn2P22389 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Edn2P22389 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Edn2P22389 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Edn2P22389 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Edn2P22389 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Edn2P22389 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Edn2P22389 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Edn2P22389 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Edn2P22389 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Edn2P22389 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Edn2P22389 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Edn2P22389 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Edn2P22389 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Edn2P22389 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Edn2P22389 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Edn2P22389 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,45■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Edn2P22389 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Edn2P22389 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Edn2P22389 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
Edn2P22389 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Edn2P22389 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Edn2P22389 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Edn2P22389 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1
Edn2P22389 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Edn2P22389 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Edn2P22389 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Edn2P22389 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Edn2P22389 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Edn2P22389 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Edn2P22389 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Edn2P22389 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Edn2P22389 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Edn2P22389 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Edn2P22389 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Edn2P22389 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Edn2P22389 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Edn2P22389 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Edn2P22389 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Edn2P22389 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Edn2P22389 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Edn2P22389 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Edn2P22389 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Edn2P22389 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Edn2P22389 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Edn2P22389 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Edn2P22389 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,91■□□□□ 0,94
Edn2P22389 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Edn2P22389 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Edn2P22389 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96,9 ms