Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VimP20152 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VimP20152 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VimP20152 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VimP20152 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VimP20152 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VimP20152 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VimP20152 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VimP20152 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VimP20152 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VimP20152 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VimP20152 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VimP20152 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VimP20152 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VimP20152 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VimP20152 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VimP20152 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VimP20152 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VimP20152 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VimP20152 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VimP20152 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VimP20152 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VimP20152 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VimP20152 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VimP20152 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VimP20152 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VimP20152 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VimP20152 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VimP20152 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VimP20152 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VimP20152 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VimP20152 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VimP20152 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VimP20152 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VimP20152 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VimP20152 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VimP20152 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VimP20152 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VimP20152 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VimP20152 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VimP20152 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VimP20152 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VimP20152 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VimP20152 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VimP20152 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VimP20152 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VimP20152 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VimP20152 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VimP20152 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VimP20152 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VimP20152 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VimP20152 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VimP20152 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VimP20152 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VimP20152 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VimP20152 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VimP20152 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VimP20152 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VimP20152 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VimP20152 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VimP20152 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VimP20152 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VimP20152 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VimP20152 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VimP20152 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VimP20152 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VimP20152 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VimP20152 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VimP20152 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VimP20152 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VimP20152 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VimP20152 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VimP20152 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VimP20152 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VimP20152 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VimP20152 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VimP20152 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VimP20152 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VimP20152 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VimP20152 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VimP20152 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VimP20152 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VimP20152 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VimP20152 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VimP20152 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VimP20152 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VimP20152 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VimP20152 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VimP20152 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VimP20152 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VimP20152 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VimP20152 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VimP20152 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VimP20152 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VimP20152 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VimP20152 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VimP20152 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VimP20152 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VimP20152 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VimP20152 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms