Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P18532 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P18532 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P18532 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
P18532 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
P18532 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P18532 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P18532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P18532 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P18532 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P18532 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P18532 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
P18532 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P18532 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P18532 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P18532 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P18532 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P18532 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P18532 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P18532 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P18532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P18532 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P18532 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P18532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P18532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P18532 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P18532 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P18532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P18532 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P18532 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P18532 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P18532 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P18532 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P18532 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P18532 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P18532 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P18532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P18532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P18532 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P18532 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P18532 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P18532 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P18532 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
P18532 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P18532 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P18532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P18532 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P18532 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P18532 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P18532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P18532 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P18532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18532 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18532 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18532 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P18532 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P18532 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P18532 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P18532 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P18532 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P18532 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P18532 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P18532 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P18532 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P18532 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P18532 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
P18532 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P18532 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
P18532 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
P18532 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P18532 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P18532 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18532 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18532 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18532 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18532 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P18532 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P18532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P18532 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P18532 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P18532 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P18532 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P18532 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P18532 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P18532 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P18532 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P18532 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P18532 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P18532 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
P18532 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P18532 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P18532 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P18532 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P18532 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P18532 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P18532 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P18532 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P18532 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P18532 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms