Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
P18532 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
P18532 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
P18532 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
P18532 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
P18532 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
P18532 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
P18532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
P18532 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
P18532 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
P18532 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
P18532 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
P18532 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
P18532 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
P18532 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
P18532 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,81■■□□□ 1,56
P18532 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
P18532 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
P18532 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
P18532 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
P18532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
P18532 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
P18532 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
P18532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
P18532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,55■■□□□ 1,52
P18532 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
P18532 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
P18532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
P18532 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
P18532 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
P18532 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
P18532 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
P18532 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P18532 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
P18532 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
P18532 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
P18532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
P18532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
P18532 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
P18532 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
P18532 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
P18532 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
P18532 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
P18532 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
P18532 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
P18532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
P18532 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
P18532 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
P18532 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
P18532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
P18532 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
P18532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
P18532 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
P18532 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,22■■□□□ 1,47
P18532 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
P18532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
P18532 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
P18532 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
P18532 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
P18532 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
P18532 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
P18532 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
P18532 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
P18532 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
P18532 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P18532 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
P18532 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
P18532 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,01■■□□□ 1,43
P18532 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
P18532 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
P18532 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
P18532 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
P18532 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P18532 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P18532 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P18532 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P18532 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
P18532 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
P18532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P18532 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P18532 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
P18532 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
P18532 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
P18532 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
P18532 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
P18532 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
P18532 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,81■■□□□ 1,4
P18532 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
P18532 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
P18532 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
P18532 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
P18532 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
P18532 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
P18532 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
P18532 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
P18532 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
P18532 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
P18532 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,7■■□□□ 1,38
P18532 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
P18532 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
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