Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighv3-6P18531 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighv3-6P18531 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv3-6P18531 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv3-6P18531 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv3-6P18531 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv3-6P18531 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv3-6P18531 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv3-6P18531 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv3-6P18531 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighv3-6P18531 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighv3-6P18531 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ighv3-6P18531 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv3-6P18531 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv3-6P18531 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ighv3-6P18531 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv3-6P18531 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv3-6P18531 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighv3-6P18531 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighv3-6P18531 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv3-6P18531 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighv3-6P18531 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighv3-6P18531 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv3-6P18531 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv3-6P18531 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv3-6P18531 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighv3-6P18531 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighv3-6P18531 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv3-6P18531 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv3-6P18531 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv3-6P18531 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv3-6P18531 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv3-6P18531 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv3-6P18531 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv3-6P18531 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv3-6P18531 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv3-6P18531 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv3-6P18531 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv3-6P18531 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv3-6P18531 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv3-6P18531 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv3-6P18531 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv3-6P18531 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv3-6P18531 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv3-6P18531 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv3-6P18531 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighv3-6P18531 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv3-6P18531 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv3-6P18531 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighv3-6P18531 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighv3-6P18531 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv3-6P18531 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv3-6P18531 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv3-6P18531 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv3-6P18531 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv3-6P18531 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv3-6P18531 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv3-6P18531 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv3-6P18531 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv3-6P18531 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv3-6P18531 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv3-6P18531 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv3-6P18531 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighv3-6P18531 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighv3-6P18531 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms