Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P18527 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
P18527 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P18527 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P18527 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P18527 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18527 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18527 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
P18527 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18527 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P18527 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P18527 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P18527 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
P18527 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P18527 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18527 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P18527 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P18527 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18527 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P18527 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P18527 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P18527 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P18527 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
P18527 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P18527 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P18527 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P18527 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18527 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18527 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18527 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18527 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18527 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18527 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18527 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18527 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
P18527 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P18527 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
P18527 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P18527 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P18527 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P18527 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
P18527 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P18527 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18527 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18527 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18527 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18527 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18527 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18527 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P18527 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18527 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18527 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18527 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18527 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P18527 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P18527 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P18527 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P18527 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P18527 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P18527 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
P18527 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P18527 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
P18527 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P18527 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18527 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18527 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18527 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18527 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18527 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18527 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P18527 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P18527 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P18527 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P18527 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P18527 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P18527 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18527 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18527 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P18527 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P18527 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P18527 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P18527 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P18527 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P18527 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18527 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18527 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18527 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P18527 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P18527 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P18527 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P18527 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18527 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18527 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18527 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P18527 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18527 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18527 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18527 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18527 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18527 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms