Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P18526 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18526 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18526 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P18526 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P18526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P18526 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
P18526 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P18526 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P18526 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P18526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P18526 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P18526 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P18526 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P18526 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
P18526 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P18526 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
P18526 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P18526 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P18526 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P18526 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P18526 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P18526 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P18526 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P18526 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P18526 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P18526 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P18526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P18526 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P18526 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P18526 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P18526 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P18526 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P18526 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P18526 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P18526 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P18526 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P18526 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P18526 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P18526 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P18526 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P18526 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P18526 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P18526 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P18526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P18526 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P18526 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P18526 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P18526 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P18526 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P18526 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P18526 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P18526 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P18526 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P18526 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P18526 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P18526 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P18526 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P18526 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P18526 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P18526 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P18526 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P18526 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P18526 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P18526 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P18526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P18526 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P18526 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P18526 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P18526 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P18526 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P18526 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P18526 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P18526 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P18526 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P18526 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P18526 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P18526 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P18526 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P18526 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P18526 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P18526 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P18526 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P18526 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P18526 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P18526 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P18526 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P18526 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P18526 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P18526 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P18526 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P18526 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P18526 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P18526 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18526 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18526 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18526 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P18526 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P18526 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P18526 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms