Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tgfb3P17125 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tgfb3P17125 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tgfb3P17125 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tgfb3P17125 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tgfb3P17125 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tgfb3P17125 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tgfb3P17125 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tgfb3P17125 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tgfb3P17125 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tgfb3P17125 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tgfb3P17125 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tgfb3P17125 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tgfb3P17125 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tgfb3P17125 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Tgfb3P17125 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Tgfb3P17125 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tgfb3P17125 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tgfb3P17125 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tgfb3P17125 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tgfb3P17125 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tgfb3P17125 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tgfb3P17125 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Tgfb3P17125 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tgfb3P17125 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tgfb3P17125 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tgfb3P17125 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tgfb3P17125 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Tgfb3P17125 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Tgfb3P17125 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tgfb3P17125 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Tgfb3P17125 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tgfb3P17125 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tgfb3P17125 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tgfb3P17125 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tgfb3P17125 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tgfb3P17125 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Tgfb3P17125 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Tgfb3P17125 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Tgfb3P17125 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tgfb3P17125 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Tgfb3P17125 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Tgfb3P17125 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Tgfb3P17125 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tgfb3P17125 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tgfb3P17125 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tgfb3P17125 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tgfb3P17125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tgfb3P17125 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tgfb3P17125 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tgfb3P17125 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tgfb3P17125 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tgfb3P17125 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tgfb3P17125 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tgfb3P17125 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tgfb3P17125 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tgfb3P17125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tgfb3P17125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Tgfb3P17125 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tgfb3P17125 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tgfb3P17125 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Tgfb3P17125 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tgfb3P17125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Tgfb3P17125 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tgfb3P17125 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Tgfb3P17125 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Tgfb3P17125 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tgfb3P17125 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Tgfb3P17125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tgfb3P17125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tgfb3P17125 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tgfb3P17125 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tgfb3P17125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tgfb3P17125 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tgfb3P17125 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfb3P17125 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfb3P17125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tgfb3P17125 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tgfb3P17125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tgfb3P17125 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tgfb3P17125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfb3P17125 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfb3P17125 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Tgfb3P17125 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tgfb3P17125 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Tgfb3P17125 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tgfb3P17125 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,9 ms