Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kcna3P16390 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Kcna3P16390 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kcna3P16390 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Kcna3P16390 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kcna3P16390 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kcna3P16390 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kcna3P16390 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kcna3P16390 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kcna3P16390 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Kcna3P16390 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Kcna3P16390 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Kcna3P16390 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kcna3P16390 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Kcna3P16390 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Kcna3P16390 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Kcna3P16390 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Kcna3P16390 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Kcna3P16390 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Kcna3P16390 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Kcna3P16390 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Kcna3P16390 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Kcna3P16390 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Kcna3P16390 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Kcna3P16390 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Kcna3P16390 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Kcna3P16390 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Kcna3P16390 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Kcna3P16390 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Kcna3P16390 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Kcna3P16390 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Kcna3P16390 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Kcna3P16390 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Kcna3P16390 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Kcna3P16390 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Kcna3P16390 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
Kcna3P16390 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Kcna3P16390 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Kcna3P16390 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Kcna3P16390 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Kcna3P16390 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Kcna3P16390 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
Kcna3P16390 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Kcna3P16390 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Kcna3P16390 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Kcna3P16390 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Kcna3P16390 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
Kcna3P16390 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Kcna3P16390 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Kcna3P16390 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Kcna3P16390 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Kcna3P16390 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Kcna3P16390 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Kcna3P16390 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Kcna3P16390 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Kcna3P16390 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Kcna3P16390 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Kcna3P16390 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Kcna3P16390 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Kcna3P16390 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Kcna3P16390 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Kcna3P16390 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Kcna3P16390 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Kcna3P16390 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kcna3P16390 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Kcna3P16390 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Kcna3P16390 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Kcna3P16390 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Kcna3P16390 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Kcna3P16390 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kcna3P16390 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kcna3P16390 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kcna3P16390 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kcna3P16390 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Kcna3P16390 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Kcna3P16390 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Kcna3P16390 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Kcna3P16390 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Kcna3P16390 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kcna3P16390 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kcna3P16390 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kcna3P16390 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kcna3P16390 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kcna3P16390 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kcna3P16390 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kcna3P16390 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Kcna3P16390 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kcna3P16390 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Kcna3P16390 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Kcna3P16390 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Kcna3P16390 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Kcna3P16390 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms