Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim30aP15533 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30aP15533 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim30aP15533 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim30aP15533 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim30aP15533 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30aP15533 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim30aP15533 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim30aP15533 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim30aP15533 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim30aP15533 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim30aP15533 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30aP15533 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30aP15533 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30aP15533 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim30aP15533 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim30aP15533 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms