Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prph2P15499 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prph2P15499 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Prph2P15499 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Prph2P15499 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Prph2P15499 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Prph2P15499 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Prph2P15499 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Prph2P15499 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Prph2P15499 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Prph2P15499 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Prph2P15499 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Prph2P15499 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Prph2P15499 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Prph2P15499 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Prph2P15499 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Prph2P15499 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Prph2P15499 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Prph2P15499 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Prph2P15499 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Prph2P15499 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Prph2P15499 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Prph2P15499 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Prph2P15499 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Prph2P15499 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Prph2P15499 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Prph2P15499 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
Prph2P15499 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,95■■□□□ 1,59
Prph2P15499 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Prph2P15499 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Prph2P15499 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Prph2P15499 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Prph2P15499 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Prph2P15499 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prph2P15499 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prph2P15499 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prph2P15499 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prph2P15499 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Prph2P15499 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Prph2P15499 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Prph2P15499 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Prph2P15499 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Prph2P15499 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Prph2P15499 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Prph2P15499 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Prph2P15499 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Prph2P15499 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Prph2P15499 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Prph2P15499 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Prph2P15499 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Prph2P15499 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Prph2P15499 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Prph2P15499 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Prph2P15499 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Prph2P15499 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Prph2P15499 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Prph2P15499 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Prph2P15499 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Prph2P15499 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Prph2P15499 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Prph2P15499 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Prph2P15499 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Prph2P15499 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Prph2P15499 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Prph2P15499 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Prph2P15499 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Prph2P15499 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Prph2P15499 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Prph2P15499 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Prph2P15499 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Prph2P15499 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Prph2P15499 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Prph2P15499 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Prph2P15499 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Prph2P15499 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Prph2P15499 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Prph2P15499 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Prph2P15499 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Prph2P15499 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Prph2P15499 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,1 ms