Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prph2P15499 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prph2P15499 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prph2P15499 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prph2P15499 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prph2P15499 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prph2P15499 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prph2P15499 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prph2P15499 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prph2P15499 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prph2P15499 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prph2P15499 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prph2P15499 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prph2P15499 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prph2P15499 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prph2P15499 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prph2P15499 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prph2P15499 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prph2P15499 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prph2P15499 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prph2P15499 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prph2P15499 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prph2P15499 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prph2P15499 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prph2P15499 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prph2P15499 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prph2P15499 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prph2P15499 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Prph2P15499 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prph2P15499 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prph2P15499 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prph2P15499 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prph2P15499 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prph2P15499 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prph2P15499 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prph2P15499 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prph2P15499 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prph2P15499 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prph2P15499 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prph2P15499 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prph2P15499 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prph2P15499 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prph2P15499 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prph2P15499 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prph2P15499 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prph2P15499 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prph2P15499 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prph2P15499 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prph2P15499 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prph2P15499 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prph2P15499 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prph2P15499 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prph2P15499 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prph2P15499 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prph2P15499 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prph2P15499 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prph2P15499 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prph2P15499 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prph2P15499 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prph2P15499 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prph2P15499 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prph2P15499 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prph2P15499 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prph2P15499 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prph2P15499 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prph2P15499 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prph2P15499 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prph2P15499 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prph2P15499 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prph2P15499 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prph2P15499 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prph2P15499 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prph2P15499 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prph2P15499 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prph2P15499 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prph2P15499 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prph2P15499 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms