Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1P13405 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1P13405 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1P13405 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1P13405 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1P13405 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rb1P13405 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1P13405 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1P13405 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1P13405 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1P13405 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1P13405 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1P13405 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1P13405 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1P13405 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1P13405 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1P13405 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1P13405 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rb1P13405 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rb1P13405 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rb1P13405 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1P13405 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1P13405 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1P13405 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1P13405 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1P13405 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1P13405 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1P13405 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1P13405 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1P13405 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1P13405 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1P13405 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms