Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1P13405 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1P13405 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1P13405 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1P13405 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1P13405 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1P13405 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1P13405 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rb1P13405 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1P13405 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1P13405 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1P13405 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rb1P13405 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1P13405 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1P13405 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1P13405 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1P13405 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1P13405 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1P13405 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rb1P13405 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rb1P13405 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1P13405 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1P13405 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1P13405 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1P13405 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rb1P13405 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rb1P13405 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rb1P13405 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rb1P13405 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1P13405 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1P13405 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1P13405 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1P13405 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1P13405 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1P13405 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1P13405 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1P13405 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1P13405 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1P13405 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1P13405 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1P13405 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1P13405 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1P13405 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1P13405 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1P13405 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms