Protein–RNA interactions for Protein: P11499

Hsp90ab1, Heat shock protein HSP 90-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsp90ab1P11499 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Hsp90ab1P11499 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Hsp90ab1P11499 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Hsp90ab1P11499 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Hsp90ab1P11499 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Hsp90ab1P11499 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Hsp90ab1P11499 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Hsp90ab1P11499 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Hsp90ab1P11499 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Hsp90ab1P11499 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Hsp90ab1P11499 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Hsp90ab1P11499 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Hsp90ab1P11499 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Hsp90ab1P11499 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Hsp90ab1P11499 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Hsp90ab1P11499 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Hsp90ab1P11499 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Hsp90ab1P11499 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Hsp90ab1P11499 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Hsp90ab1P11499 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Hsp90ab1P11499 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Hsp90ab1P11499 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Hsp90ab1P11499 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Hsp90ab1P11499 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Hsp90ab1P11499 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Hsp90ab1P11499 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Hsp90ab1P11499 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Hsp90ab1P11499 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,85■■■■□ 3,17
Hsp90ab1P11499 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Hsp90ab1P11499 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Hsp90ab1P11499 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Hsp90ab1P11499 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Hsp90ab1P11499 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Hsp90ab1P11499 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Hsp90ab1P11499 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Hsp90ab1P11499 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Hsp90ab1P11499 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Hsp90ab1P11499 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Hsp90ab1P11499 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Hsp90ab1P11499 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Hsp90ab1P11499 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Hsp90ab1P11499 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Hsp90ab1P11499 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Hsp90ab1P11499 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Hsp90ab1P11499 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Hsp90ab1P11499 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Hsp90ab1P11499 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Hsp90ab1P11499 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Hsp90ab1P11499 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Hsp90ab1P11499 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Hsp90ab1P11499 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Hsp90ab1P11499 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Hsp90ab1P11499 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Hsp90ab1P11499 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Hsp90ab1P11499 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Hsp90ab1P11499 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Hsp90ab1P11499 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Hsp90ab1P11499 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Hsp90ab1P11499 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Hsp90ab1P11499 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Hsp90ab1P11499 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Hsp90ab1P11499 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Hsp90ab1P11499 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Hsp90ab1P11499 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Hsp90ab1P11499 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Hsp90ab1P11499 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Hsp90ab1P11499 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Hsp90ab1P11499 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Hsp90ab1P11499 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Hsp90ab1P11499 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Hsp90ab1P11499 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Hsp90ab1P11499 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Hsp90ab1P11499 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Hsp90ab1P11499 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,82■■■■□ 3
Hsp90ab1P11499 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Hsp90ab1P11499 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Hsp90ab1P11499 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Hsp90ab1P11499 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Hsp90ab1P11499 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hsp90ab1P11499 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Hsp90ab1P11499 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
Hsp90ab1P11499 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hsp90ab1P11499 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Hsp90ab1P11499 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Hsp90ab1P11499 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Hsp90ab1P11499 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Hsp90ab1P11499 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Hsp90ab1P11499 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Hsp90ab1P11499 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Hsp90ab1P11499 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Hsp90ab1P11499 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Hsp90ab1P11499 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Hsp90ab1P11499 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Hsp90ab1P11499 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms