Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nid1P10493 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nid1P10493 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nid1P10493 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nid1P10493 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nid1P10493 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nid1P10493 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid1P10493 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid1P10493 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nid1P10493 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nid1P10493 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid1P10493 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid1P10493 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid1P10493 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid1P10493 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid1P10493 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid1P10493 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nid1P10493 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nid1P10493 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid1P10493 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nid1P10493 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid1P10493 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid1P10493 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid1P10493 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid1P10493 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid1P10493 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid1P10493 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid1P10493 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid1P10493 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid1P10493 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nid1P10493 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid1P10493 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid1P10493 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid1P10493 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid1P10493 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid1P10493 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nid1P10493 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid1P10493 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid1P10493 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid1P10493 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid1P10493 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid1P10493 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid1P10493 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid1P10493 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid1P10493 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid1P10493 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid1P10493 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid1P10493 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nid1P10493 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid1P10493 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid1P10493 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid1P10493 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nid1P10493 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid1P10493 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid1P10493 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid1P10493 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid1P10493 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid1P10493 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid1P10493 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid1P10493 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid1P10493 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nid1P10493 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nid1P10493 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid1P10493 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid1P10493 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nid1P10493 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid1P10493 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nid1P10493 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid1P10493 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid1P10493 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid1P10493 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid1P10493 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid1P10493 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid1P10493 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid1P10493 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nid1P10493 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid1P10493 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid1P10493 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid1P10493 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid1P10493 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid1P10493 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid1P10493 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid1P10493 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid1P10493 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid1P10493 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid1P10493 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid1P10493 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid1P10493 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms