Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh3P10287 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh3P10287 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh3P10287 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh3P10287 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh3P10287 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh3P10287 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh3P10287 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh3P10287 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh3P10287 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh3P10287 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh3P10287 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh3P10287 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh3P10287 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh3P10287 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh3P10287 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh3P10287 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh3P10287 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh3P10287 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh3P10287 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh3P10287 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh3P10287 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh3P10287 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh3P10287 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh3P10287 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh3P10287 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh3P10287 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh3P10287 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh3P10287 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh3P10287 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh3P10287 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh3P10287 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh3P10287 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh3P10287 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh3P10287 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh3P10287 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh3P10287 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh3P10287 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh3P10287 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh3P10287 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh3P10287 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh3P10287 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh3P10287 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh3P10287 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh3P10287 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh3P10287 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh3P10287 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh3P10287 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh3P10287 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh3P10287 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh3P10287 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh3P10287 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh3P10287 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh3P10287 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh3P10287 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh3P10287 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh3P10287 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh3P10287 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh3P10287 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh3P10287 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh3P10287 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh3P10287 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh3P10287 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh3P10287 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh3P10287 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh3P10287 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh3P10287 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh3P10287 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh3P10287 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh3P10287 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh3P10287 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh3P10287 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh3P10287 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh3P10287 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 327 ms