Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
UbbP0CG49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,6■■□□□ 1,37
UbbP0CG49 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
UbbP0CG49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
UbbP0CG49 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
UbbP0CG49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
UbbP0CG49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
UbbP0CG49 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,49■■□□□ 1,35
UbbP0CG49 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
UbbP0CG49 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
UbbP0CG49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
UbbP0CG49 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
UbbP0CG49 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
UbbP0CG49 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
UbbP0CG49 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,34■■□□□ 1,33
UbbP0CG49 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
UbbP0CG49 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
UbbP0CG49 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,29■■□□□ 1,32
UbbP0CG49 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
UbbP0CG49 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
UbbP0CG49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
UbbP0CG49 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
UbbP0CG49 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
UbbP0CG49 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
UbbP0CG49 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
UbbP0CG49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
UbbP0CG49 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
UbbP0CG49 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
UbbP0CG49 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
UbbP0CG49 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
UbbP0CG49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
UbbP0CG49 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
UbbP0CG49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
UbbP0CG49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
UbbP0CG49 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
UbbP0CG49 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
UbbP0CG49 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,01■■□□□ 1,27
UbbP0CG49 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
UbbP0CG49 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
UbbP0CG49 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,85■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
UbbP0CG49 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,81■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
UbbP0CG49 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,77■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,73■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
UbbP0CG49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
UbbP0CG49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
UbbP0CG49 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
UbbP0CG49 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
UbbP0CG49 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
UbbP0CG49 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
UbbP0CG49 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,56■■□□□ 1,2
UbbP0CG49 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
UbbP0CG49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
UbbP0CG49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
UbbP0CG49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
UbbP0CG49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms