Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UbbP0CG49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UbbP0CG49 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UbbP0CG49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UbbP0CG49 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UbbP0CG49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UbbP0CG49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UbbP0CG49 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbbP0CG49 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbbP0CG49 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbbP0CG49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbbP0CG49 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UbbP0CG49 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UbbP0CG49 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UbbP0CG49 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UbbP0CG49 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UbbP0CG49 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UbbP0CG49 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UbbP0CG49 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UbbP0CG49 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UbbP0CG49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UbbP0CG49 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UbbP0CG49 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UbbP0CG49 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UbbP0CG49 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UbbP0CG49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UbbP0CG49 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UbbP0CG49 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UbbP0CG49 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UbbP0CG49 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UbbP0CG49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UbbP0CG49 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UbbP0CG49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UbbP0CG49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UbbP0CG49 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UbbP0CG49 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UbbP0CG49 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UbbP0CG49 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UbbP0CG49 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UbbP0CG49 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbbP0CG49 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbbP0CG49 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbbP0CG49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UbbP0CG49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UbbP0CG49 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbbP0CG49 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbbP0CG49 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbbP0CG49 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbbP0CG49 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbbP0CG49 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbbP0CG49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UbbP0CG49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UbbP0CG49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms