Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Hoxc9P09633 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Hoxc9P09633 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Hoxc9P09633 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Hoxc9P09633 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Hoxc9P09633 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Hoxc9P09633 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Hoxc9P09633 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Hoxc9P09633 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Hoxc9P09633 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Hoxc9P09633 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Hoxc9P09633 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Hoxc9P09633 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Hoxc9P09633 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Hoxc9P09633 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Hoxc9P09633 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Hoxc9P09633 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Hoxc9P09633 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Hoxc9P09633 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Hoxc9P09633 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Hoxc9P09633 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hoxc9P09633 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Hoxc9P09633 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Hoxc9P09633 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hoxc9P09633 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Hoxc9P09633 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Hoxc9P09633 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Hoxc9P09633 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Hoxc9P09633 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Hoxc9P09633 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hoxc9P09633 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hoxc9P09633 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hoxc9P09633 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Hoxc9P09633 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Hoxc9P09633 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Hoxc9P09633 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Hoxc9P09633 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Hoxc9P09633 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Hoxc9P09633 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Hoxc9P09633 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hoxc9P09633 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hoxc9P09633 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Hoxc9P09633 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Hoxc9P09633 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Hoxc9P09633 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Hoxc9P09633 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Hoxc9P09633 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hoxc9P09633 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hoxc9P09633 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Hoxc9P09633 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Hoxc9P09633 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Hoxc9P09633 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Hoxc9P09633 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Hoxc9P09633 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Hoxc9P09633 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Hoxc9P09633 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hoxc9P09633 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hoxc9P09633 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Hoxc9P09633 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hoxc9P09633 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Hoxc9P09633 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hoxc9P09633 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Hoxc9P09633 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hoxc9P09633 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hoxc9P09633 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hoxc9P09633 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Hoxc9P09633 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Hoxc9P09633 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Hoxc9P09633 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Hoxc9P09633 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Hoxc9P09633 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Hoxc9P09633 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Hoxc9P09633 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Hoxc9P09633 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Hoxc9P09633 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Hoxc9P09633 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Hoxc9P09633 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hoxc9P09633 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hoxc9P09633 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Hoxc9P09633 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hoxc9P09633 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Hoxc9P09633 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hoxc9P09633 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hoxc9P09633 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Hoxc9P09633 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Hoxc9P09633 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Hoxc9P09633 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms