Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Csf1rP09581 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Csf1rP09581 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Csf1rP09581 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Csf1rP09581 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Csf1rP09581 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Csf1rP09581 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Csf1rP09581 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Csf1rP09581 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Csf1rP09581 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Csf1rP09581 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Csf1rP09581 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Csf1rP09581 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Csf1rP09581 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Csf1rP09581 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Csf1rP09581 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Csf1rP09581 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Csf1rP09581 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3,03
Csf1rP09581 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Csf1rP09581 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Csf1rP09581 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Csf1rP09581 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Csf1rP09581 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Csf1rP09581 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Csf1rP09581 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Csf1rP09581 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Csf1rP09581 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Csf1rP09581 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Csf1rP09581 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Csf1rP09581 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Csf1rP09581 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Csf1rP09581 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Csf1rP09581 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Csf1rP09581 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Csf1rP09581 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Csf1rP09581 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
Csf1rP09581 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Csf1rP09581 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Csf1rP09581 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Csf1rP09581 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Csf1rP09581 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Csf1rP09581 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Csf1rP09581 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Csf1rP09581 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Csf1rP09581 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Csf1rP09581 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Csf1rP09581 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Csf1rP09581 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Csf1rP09581 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Csf1rP09581 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Csf1rP09581 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Csf1rP09581 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Csf1rP09581 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Csf1rP09581 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Csf1rP09581 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Csf1rP09581 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Csf1rP09581 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Csf1rP09581 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Csf1rP09581 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Csf1rP09581 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Csf1rP09581 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Csf1rP09581 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Csf1rP09581 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Csf1rP09581 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Csf1rP09581 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Csf1rP09581 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Csf1rP09581 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Csf1rP09581 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Csf1rP09581 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Csf1rP09581 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Csf1rP09581 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Csf1rP09581 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Csf1rP09581 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Csf1rP09581 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Csf1rP09581 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Csf1rP09581 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms