Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna6P07350 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna6P07350 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna6P07350 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna6P07350 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna6P07350 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna6P07350 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifna6P07350 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifna6P07350 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifna6P07350 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifna6P07350 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifna6P07350 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifna6P07350 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifna6P07350 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifna6P07350 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna6P07350 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifna6P07350 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifna6P07350 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifna6P07350 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifna6P07350 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifna6P07350 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifna6P07350 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna6P07350 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna6P07350 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifna6P07350 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ifna6P07350 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna6P07350 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifna6P07350 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifna6P07350 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifna6P07350 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifna6P07350 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna6P07350 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifna6P07350 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifna6P07350 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifna6P07350 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna6P07350 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna6P07350 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna6P07350 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifna6P07350 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifna6P07350 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifna6P07350 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifna6P07350 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna6P07350 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna6P07350 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna6P07350 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna6P07350 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna6P07350 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifna6P07350 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna6P07350 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifna6P07350 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifna6P07350 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna6P07350 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna6P07350 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifna6P07350 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna6P07350 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna6P07350 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna6P07350 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna6P07350 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna6P07350 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifna6P07350 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna6P07350 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna6P07350 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifna6P07350 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna6P07350 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna6P07350 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifna6P07350 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifna6P07350 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifna6P07350 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifna6P07350 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifna6P07350 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna6P07350 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna6P07350 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna6P07350 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna6P07350 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms