Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
P01878 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
P01878 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
P01878 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
P01878 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
P01878 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
P01878 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
P01878 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
P01878 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
P01878 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
P01878 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
P01878 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
P01878 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
P01878 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
P01878 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
P01878 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
P01878 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
P01878 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
P01878 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
P01878 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
P01878 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
P01878 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
P01878 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
P01878 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
P01878 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
P01878 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
P01878 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
P01878 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
P01878 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
P01878 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
P01878 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,07■■■□□ 2,24
P01878 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
P01878 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
P01878 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
P01878 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
P01878 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
P01878 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
P01878 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
P01878 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
P01878 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
P01878 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
P01878 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
P01878 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
P01878 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
P01878 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
P01878 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
P01878 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
P01878 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
P01878 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
P01878 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
P01878 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
P01878 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
P01878 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
P01878 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
P01878 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
P01878 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
P01878 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
P01878 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
P01878 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
P01878 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
P01878 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
P01878 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
P01878 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
P01878 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
P01878 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
P01878 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
P01878 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
P01878 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
P01878 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
P01878 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
P01878 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
P01878 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
P01878 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
P01878 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
P01878 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
P01878 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
P01878 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
P01878 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
P01878 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
P01878 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
P01878 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
P01878 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
P01878 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
P01878 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
P01878 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
P01878 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
P01878 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
P01878 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
P01878 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
P01878 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
P01878 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
P01878 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
P01878 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
P01878 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
P01878 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
P01878 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
P01878 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
P01878 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
P01878 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
P01878 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms