Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifna2P01573 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifna2P01573 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifna2P01573 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifna2P01573 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifna2P01573 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifna2P01573 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna2P01573 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifna2P01573 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifna2P01573 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifna2P01573 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifna2P01573 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna2P01573 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifna2P01573 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna2P01573 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifna2P01573 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna2P01573 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifna2P01573 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifna2P01573 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifna2P01573 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna2P01573 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna2P01573 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifna2P01573 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna2P01573 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna2P01573 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna2P01573 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna2P01573 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifna2P01573 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifna2P01573 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifna2P01573 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifna2P01573 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna2P01573 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna2P01573 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifna2P01573 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna2P01573 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna2P01573 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifna2P01573 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifna2P01573 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna2P01573 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifna2P01573 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna2P01573 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifna2P01573 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifna2P01573 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifna2P01573 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna2P01573 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna2P01573 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifna2P01573 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna2P01573 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifna2P01573 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifna2P01573 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna2P01573 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna2P01573 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifna2P01573 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifna2P01573 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifna2P01573 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna2P01573 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifna2P01573 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna2P01573 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms