Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,84■■■■□ 3,33
C4bP01029 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,82■■■■□ 3,32
C4bP01029 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
C4bP01029 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
C4bP01029 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
C4bP01029 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,68■■■■□ 3,3
C4bP01029 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
C4bP01029 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
C4bP01029 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
C4bP01029 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
C4bP01029 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
C4bP01029 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
C4bP01029 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
C4bP01029 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
C4bP01029 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
C4bP01029 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
C4bP01029 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
C4bP01029 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
C4bP01029 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
C4bP01029 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
C4bP01029 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
C4bP01029 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
C4bP01029 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,24
C4bP01029 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
C4bP01029 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
C4bP01029 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
C4bP01029 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
C4bP01029 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
C4bP01029 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
C4bP01029 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
C4bP01029 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
C4bP01029 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
C4bP01029 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,07■■■■□ 3,2
C4bP01029 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,06■■■■□ 3,2
C4bP01029 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
C4bP01029 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
C4bP01029 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
C4bP01029 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,01■■■■□ 3,19
C4bP01029 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
C4bP01029 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
C4bP01029 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
C4bP01029 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
C4bP01029 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
C4bP01029 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
C4bP01029 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
C4bP01029 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
C4bP01029 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
C4bP01029 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
C4bP01029 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
C4bP01029 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
C4bP01029 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
C4bP01029 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
C4bP01029 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
C4bP01029 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
C4bP01029 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
C4bP01029 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,64■■■■□ 3,14
C4bP01029 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
C4bP01029 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
C4bP01029 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
C4bP01029 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
C4bP01029 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
C4bP01029 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
C4bP01029 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,47■■■■□ 3,11
C4bP01029 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
C4bP01029 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
C4bP01029 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
C4bP01029 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
C4bP01029 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
C4bP01029 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
C4bP01029 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
C4bP01029 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
C4bP01029 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
C4bP01029 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
C4bP01029 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
C4bP01029 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
C4bP01029 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
C4bP01029 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,22■■■■□ 3,07
C4bP01029 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
C4bP01029 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,2■■■■□ 3,07
C4bP01029 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,2■■■■□ 3,07
C4bP01029 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
C4bP01029 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
C4bP01029 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
C4bP01029 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
C4bP01029 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
C4bP01029 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
C4bP01029 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,05
C4bP01029 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
C4bP01029 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
C4bP01029 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
C4bP01029 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
C4bP01029 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3,03
C4bP01029 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,99■■■■□ 3,03
C4bP01029 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
C4bP01029 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
C4bP01029 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
C4bP01029 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
C4bP01029 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
C4bP01029 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
C4bP01029 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms