Protein–RNA interactions for Protein: P00342

Ldhc, L-lactate dehydrogenase C chain, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhcP00342 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LdhcP00342 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LdhcP00342 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LdhcP00342 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LdhcP00342 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LdhcP00342 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LdhcP00342 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LdhcP00342 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LdhcP00342 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LdhcP00342 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LdhcP00342 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LdhcP00342 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LdhcP00342 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LdhcP00342 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LdhcP00342 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LdhcP00342 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LdhcP00342 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LdhcP00342 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LdhcP00342 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LdhcP00342 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LdhcP00342 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LdhcP00342 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LdhcP00342 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LdhcP00342 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LdhcP00342 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LdhcP00342 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LdhcP00342 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LdhcP00342 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LdhcP00342 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LdhcP00342 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LdhcP00342 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LdhcP00342 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LdhcP00342 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LdhcP00342 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LdhcP00342 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LdhcP00342 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LdhcP00342 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LdhcP00342 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LdhcP00342 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LdhcP00342 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LdhcP00342 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LdhcP00342 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LdhcP00342 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LdhcP00342 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LdhcP00342 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LdhcP00342 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LdhcP00342 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LdhcP00342 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LdhcP00342 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LdhcP00342 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LdhcP00342 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LdhcP00342 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LdhcP00342 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LdhcP00342 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LdhcP00342 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LdhcP00342 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LdhcP00342 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LdhcP00342 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LdhcP00342 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LdhcP00342 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LdhcP00342 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LdhcP00342 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LdhcP00342 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LdhcP00342 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LdhcP00342 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LdhcP00342 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LdhcP00342 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LdhcP00342 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LdhcP00342 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LdhcP00342 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LdhcP00342 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LdhcP00342 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LdhcP00342 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LdhcP00342 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LdhcP00342 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LdhcP00342 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LdhcP00342 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LdhcP00342 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LdhcP00342 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms