Protein–RNA interactions for Protein: O89017

Lgmn, Legumain, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgmnO89017 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LgmnO89017 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LgmnO89017 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LgmnO89017 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LgmnO89017 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LgmnO89017 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LgmnO89017 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LgmnO89017 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LgmnO89017 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LgmnO89017 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LgmnO89017 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LgmnO89017 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LgmnO89017 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LgmnO89017 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LgmnO89017 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LgmnO89017 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LgmnO89017 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LgmnO89017 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LgmnO89017 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LgmnO89017 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LgmnO89017 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LgmnO89017 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LgmnO89017 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LgmnO89017 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LgmnO89017 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LgmnO89017 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LgmnO89017 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LgmnO89017 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LgmnO89017 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LgmnO89017 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LgmnO89017 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LgmnO89017 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LgmnO89017 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LgmnO89017 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LgmnO89017 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LgmnO89017 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LgmnO89017 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LgmnO89017 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LgmnO89017 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LgmnO89017 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LgmnO89017 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LgmnO89017 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LgmnO89017 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LgmnO89017 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LgmnO89017 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LgmnO89017 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LgmnO89017 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LgmnO89017 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LgmnO89017 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LgmnO89017 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LgmnO89017 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LgmnO89017 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LgmnO89017 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LgmnO89017 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LgmnO89017 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LgmnO89017 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LgmnO89017 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LgmnO89017 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LgmnO89017 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LgmnO89017 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LgmnO89017 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LgmnO89017 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LgmnO89017 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LgmnO89017 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LgmnO89017 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LgmnO89017 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LgmnO89017 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LgmnO89017 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgmnO89017 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgmnO89017 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LgmnO89017 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LgmnO89017 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LgmnO89017 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LgmnO89017 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LgmnO89017 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LgmnO89017 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LgmnO89017 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LgmnO89017 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LgmnO89017 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LgmnO89017 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LgmnO89017 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LgmnO89017 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LgmnO89017 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LgmnO89017 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LgmnO89017 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LgmnO89017 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms