Protein–RNA interactions for Protein: O88962

Cyp8b1, 7-alpha-hydroxycholest-4-en-3-one 12-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp8b1O88962 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp8b1O88962 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp8b1O88962 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp8b1O88962 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp8b1O88962 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp8b1O88962 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp8b1O88962 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyp8b1O88962 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cyp8b1O88962 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cyp8b1O88962 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cyp8b1O88962 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyp8b1O88962 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cyp8b1O88962 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cyp8b1O88962 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cyp8b1O88962 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyp8b1O88962 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cyp8b1O88962 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp8b1O88962 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp8b1O88962 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cyp8b1O88962 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cyp8b1O88962 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp8b1O88962 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp8b1O88962 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp8b1O88962 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp8b1O88962 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp8b1O88962 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp8b1O88962 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp8b1O88962 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp8b1O88962 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp8b1O88962 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp8b1O88962 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp8b1O88962 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp8b1O88962 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp8b1O88962 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp8b1O88962 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp8b1O88962 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp8b1O88962 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp8b1O88962 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp8b1O88962 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cyp8b1O88962 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp8b1O88962 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp8b1O88962 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp8b1O88962 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp8b1O88962 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp8b1O88962 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp8b1O88962 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp8b1O88962 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp8b1O88962 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp8b1O88962 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp8b1O88962 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp8b1O88962 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp8b1O88962 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp8b1O88962 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp8b1O88962 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp8b1O88962 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp8b1O88962 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp8b1O88962 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp8b1O88962 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp8b1O88962 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp8b1O88962 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp8b1O88962 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp8b1O88962 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp8b1O88962 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp8b1O88962 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp8b1O88962 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp8b1O88962 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp8b1O88962 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp8b1O88962 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp8b1O88962 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp8b1O88962 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cyp8b1O88962 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp8b1O88962 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp8b1O88962 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp8b1O88962 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cyp8b1O88962 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp8b1O88962 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms