Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Aff1O88573 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Aff1O88573 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aff1O88573 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Aff1O88573 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aff1O88573 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Aff1O88573 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aff1O88573 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aff1O88573 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aff1O88573 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aff1O88573 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aff1O88573 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aff1O88573 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aff1O88573 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Aff1O88573 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aff1O88573 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aff1O88573 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aff1O88573 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aff1O88573 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aff1O88573 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Aff1O88573 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Aff1O88573 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Aff1O88573 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aff1O88573 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Aff1O88573 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Aff1O88573 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aff1O88573 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aff1O88573 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aff1O88573 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aff1O88573 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Aff1O88573 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aff1O88573 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aff1O88573 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aff1O88573 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Aff1O88573 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Aff1O88573 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Aff1O88573 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aff1O88573 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aff1O88573 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Aff1O88573 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aff1O88573 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Aff1O88573 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aff1O88573 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Aff1O88573 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aff1O88573 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aff1O88573 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aff1O88573 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Aff1O88573 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aff1O88573 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aff1O88573 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Aff1O88573 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Aff1O88573 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Aff1O88573 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Aff1O88573 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aff1O88573 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Aff1O88573 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Aff1O88573 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aff1O88573 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aff1O88573 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aff1O88573 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aff1O88573 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aff1O88573 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aff1O88573 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aff1O88573 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aff1O88573 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Aff1O88573 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aff1O88573 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aff1O88573 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aff1O88573 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Aff1O88573 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Aff1O88573 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aff1O88573 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aff1O88573 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Aff1O88573 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aff1O88573 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aff1O88573 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Aff1O88573 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aff1O88573 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aff1O88573 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aff1O88573 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aff1O88573 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aff1O88573 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aff1O88573 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aff1O88573 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aff1O88573 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aff1O88573 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aff1O88573 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aff1O88573 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aff1O88573 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aff1O88573 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aff1O88573 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aff1O88573 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aff1O88573 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aff1O88573 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aff1O88573 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Aff1O88573 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Aff1O88573 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aff1O88573 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aff1O88573 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aff1O88573 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms