Protein–RNA interactions for Protein: O88492

Plin4, Perilipin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plin4O88492 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Plin4O88492 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Plin4O88492 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Plin4O88492 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Plin4O88492 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Plin4O88492 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Plin4O88492 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Plin4O88492 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Plin4O88492 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Plin4O88492 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Plin4O88492 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Plin4O88492 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Plin4O88492 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Plin4O88492 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Plin4O88492 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Plin4O88492 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Plin4O88492 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Plin4O88492 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Plin4O88492 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Plin4O88492 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Plin4O88492 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Plin4O88492 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Plin4O88492 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Plin4O88492 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Plin4O88492 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Plin4O88492 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plin4O88492 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Plin4O88492 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Plin4O88492 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Plin4O88492 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Plin4O88492 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Plin4O88492 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Plin4O88492 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Plin4O88492 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plin4O88492 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plin4O88492 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plin4O88492 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Plin4O88492 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Plin4O88492 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Plin4O88492 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Plin4O88492 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Plin4O88492 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Plin4O88492 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Plin4O88492 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plin4O88492 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plin4O88492 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plin4O88492 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Plin4O88492 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plin4O88492 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Plin4O88492 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plin4O88492 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Plin4O88492 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plin4O88492 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plin4O88492 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plin4O88492 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plin4O88492 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plin4O88492 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plin4O88492 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Plin4O88492 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plin4O88492 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plin4O88492 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plin4O88492 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Plin4O88492 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plin4O88492 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plin4O88492 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plin4O88492 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plin4O88492 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Plin4O88492 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Plin4O88492 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Plin4O88492 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plin4O88492 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plin4O88492 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plin4O88492 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plin4O88492 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plin4O88492 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plin4O88492 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plin4O88492 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plin4O88492 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plin4O88492 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plin4O88492 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plin4O88492 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Plin4O88492 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plin4O88492 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plin4O88492 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plin4O88492 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plin4O88492 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms