Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Nid2O88322 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Nid2O88322 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Nid2O88322 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Nid2O88322 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Nid2O88322 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Nid2O88322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Nid2O88322 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Nid2O88322 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Nid2O88322 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Nid2O88322 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Nid2O88322 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
Nid2O88322 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Nid2O88322 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Nid2O88322 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Nid2O88322 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Nid2O88322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Nid2O88322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37,4■■■■□ 3,58
Nid2O88322 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,39■■■■□ 3,58
Nid2O88322 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Nid2O88322 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Nid2O88322 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Nid2O88322 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,32■■■■□ 3,56
Nid2O88322 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Nid2O88322 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Nid2O88322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Nid2O88322 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Nid2O88322 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Nid2O88322 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Nid2O88322 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Nid2O88322 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Nid2O88322 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Nid2O88322 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Nid2O88322 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
Nid2O88322 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Nid2O88322 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Nid2O88322 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Nid2O88322 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Nid2O88322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Nid2O88322 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Nid2O88322 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Nid2O88322 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Nid2O88322 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36,88■■■■□ 3,49
Nid2O88322 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Nid2O88322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
Nid2O88322 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Nid2O88322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Nid2O88322 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Nid2O88322 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36,82■■■■□ 3,49
Nid2O88322 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Nid2O88322 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Nid2O88322 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Nid2O88322 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Nid2O88322 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Nid2O88322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,76■■■■□ 3,47
Nid2O88322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Nid2O88322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Nid2O88322 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Nid2O88322 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Nid2O88322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Nid2O88322 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Nid2O88322 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Nid2O88322 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Nid2O88322 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Nid2O88322 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Nid2O88322 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Nid2O88322 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Nid2O88322 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,32■■■■□ 3,41
Nid2O88322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Nid2O88322 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Nid2O88322 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Nid2O88322 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Nid2O88322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Nid2O88322 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Nid2O88322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Nid2O88322 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Nid2O88322 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Nid2O88322 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Nid2O88322 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Nid2O88322 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Nid2O88322 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,11■■■■□ 3,37
Nid2O88322 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Nid2O88322 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Nid2O88322 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nid2O88322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nid2O88322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nid2O88322 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nid2O88322 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nid2O88322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Nid2O88322 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Nid2O88322 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Nid2O88322 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Nid2O88322 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Nid2O88322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms