Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mid1O70583 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mid1O70583 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mid1O70583 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mid1O70583 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mid1O70583 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mid1O70583 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Mid1O70583 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mid1O70583 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mid1O70583 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mid1O70583 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mid1O70583 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mid1O70583 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mid1O70583 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mid1O70583 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Mid1O70583 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mid1O70583 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mid1O70583 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mid1O70583 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mid1O70583 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mid1O70583 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mid1O70583 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mid1O70583 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mid1O70583 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mid1O70583 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mid1O70583 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mid1O70583 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mid1O70583 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mid1O70583 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mid1O70583 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mid1O70583 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mid1O70583 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mid1O70583 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mid1O70583 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Mid1O70583 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mid1O70583 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mid1O70583 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mid1O70583 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mid1O70583 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mid1O70583 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mid1O70583 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mid1O70583 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mid1O70583 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mid1O70583 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mid1O70583 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mid1O70583 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mid1O70583 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mid1O70583 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mid1O70583 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mid1O70583 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mid1O70583 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mid1O70583 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mid1O70583 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mid1O70583 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mid1O70583 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Mid1O70583 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mid1O70583 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mid1O70583 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mid1O70583 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mid1O70583 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mid1O70583 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Mid1O70583 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mid1O70583 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mid1O70583 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mid1O70583 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mid1O70583 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mid1O70583 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mid1O70583 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mid1O70583 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mid1O70583 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Mid1O70583 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mid1O70583 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mid1O70583 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms