Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CtssO70370 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CtssO70370 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CtssO70370 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CtssO70370 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CtssO70370 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CtssO70370 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CtssO70370 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CtssO70370 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CtssO70370 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CtssO70370 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CtssO70370 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CtssO70370 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CtssO70370 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CtssO70370 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CtssO70370 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CtssO70370 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CtssO70370 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CtssO70370 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CtssO70370 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CtssO70370 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CtssO70370 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CtssO70370 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CtssO70370 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CtssO70370 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CtssO70370 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CtssO70370 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CtssO70370 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CtssO70370 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CtssO70370 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CtssO70370 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CtssO70370 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CtssO70370 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CtssO70370 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CtssO70370 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CtssO70370 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CtssO70370 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CtssO70370 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CtssO70370 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CtssO70370 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CtssO70370 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CtssO70370 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CtssO70370 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CtssO70370 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CtssO70370 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CtssO70370 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CtssO70370 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CtssO70370 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CtssO70370 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CtssO70370 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CtssO70370 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CtssO70370 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CtssO70370 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CtssO70370 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CtssO70370 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CtssO70370 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CtssO70370 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CtssO70370 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CtssO70370 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CtssO70370 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CtssO70370 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CtssO70370 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CtssO70370 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CtssO70370 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CtssO70370 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CtssO70370 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CtssO70370 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CtssO70370 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CtssO70370 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CtssO70370 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CtssO70370 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CtssO70370 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CtssO70370 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CtssO70370 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CtssO70370 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CtssO70370 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CtssO70370 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtssO70370 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CtssO70370 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CtssO70370 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CtssO70370 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CtssO70370 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CtssO70370 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CtssO70370 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CtssO70370 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CtssO70370 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CtssO70370 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CtssO70370 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CtssO70370 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CtssO70370 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtssO70370 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CtssO70370 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CtssO70370 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CtssO70370 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CtssO70370 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CtssO70370 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CtssO70370 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CtssO70370 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CtssO70370 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtssO70370 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms