Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brs3O54798 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brs3O54798 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brs3O54798 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brs3O54798 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brs3O54798 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brs3O54798 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brs3O54798 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brs3O54798 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brs3O54798 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brs3O54798 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brs3O54798 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brs3O54798 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brs3O54798 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brs3O54798 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brs3O54798 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brs3O54798 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brs3O54798 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brs3O54798 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brs3O54798 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brs3O54798 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brs3O54798 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brs3O54798 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brs3O54798 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brs3O54798 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brs3O54798 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brs3O54798 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brs3O54798 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brs3O54798 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brs3O54798 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brs3O54798 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brs3O54798 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brs3O54798 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brs3O54798 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brs3O54798 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brs3O54798 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brs3O54798 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brs3O54798 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brs3O54798 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brs3O54798 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brs3O54798 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brs3O54798 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brs3O54798 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brs3O54798 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brs3O54798 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brs3O54798 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brs3O54798 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brs3O54798 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Brs3O54798 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brs3O54798 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brs3O54798 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brs3O54798 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brs3O54798 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brs3O54798 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brs3O54798 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brs3O54798 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brs3O54798 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brs3O54798 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brs3O54798 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brs3O54798 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brs3O54798 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brs3O54798 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brs3O54798 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brs3O54798 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brs3O54798 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brs3O54798 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brs3O54798 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brs3O54798 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brs3O54798 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brs3O54798 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brs3O54798 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brs3O54798 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brs3O54798 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brs3O54798 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brs3O54798 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms