Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Brs3O54798 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Brs3O54798 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Brs3O54798 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Brs3O54798 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Brs3O54798 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Brs3O54798 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Brs3O54798 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Brs3O54798 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Brs3O54798 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Brs3O54798 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Brs3O54798 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Brs3O54798 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
Brs3O54798 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Brs3O54798 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Brs3O54798 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Brs3O54798 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Brs3O54798 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Brs3O54798 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Brs3O54798 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Brs3O54798 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Brs3O54798 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Brs3O54798 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,27■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Brs3O54798 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Brs3O54798 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Brs3O54798 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Brs3O54798 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Brs3O54798 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Brs3O54798 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Brs3O54798 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Brs3O54798 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Brs3O54798 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Brs3O54798 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Brs3O54798 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Brs3O54798 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Brs3O54798 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Brs3O54798 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Brs3O54798 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Brs3O54798 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Brs3O54798 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Brs3O54798 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Brs3O54798 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Brs3O54798 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Brs3O54798 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Brs3O54798 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Brs3O54798 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Brs3O54798 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Brs3O54798 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Brs3O54798 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Brs3O54798 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Brs3O54798 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Brs3O54798 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Brs3O54798 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
Brs3O54798 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Brs3O54798 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Brs3O54798 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Brs3O54798 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Brs3O54798 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Brs3O54798 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Brs3O54798 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Brs3O54798 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Brs3O54798 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Brs3O54798 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Brs3O54798 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Brs3O54798 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Brs3O54798 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Brs3O54798 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Brs3O54798 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Brs3O54798 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Brs3O54798 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Brs3O54798 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Brs3O54798 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Brs3O54798 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Brs3O54798 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Brs3O54798 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms