Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl25O35903 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms