Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl25O35903 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl25O35903 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl25O35903 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl25O35903 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl25O35903 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl25O35903 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl25O35903 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl25O35903 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl25O35903 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl25O35903 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl25O35903 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl25O35903 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl25O35903 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl25O35903 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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