Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PhyhO35386 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhyhO35386 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PhyhO35386 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhyhO35386 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PhyhO35386 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PhyhO35386 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PhyhO35386 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PhyhO35386 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PhyhO35386 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PhyhO35386 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PhyhO35386 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PhyhO35386 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PhyhO35386 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PhyhO35386 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PhyhO35386 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PhyhO35386 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PhyhO35386 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PhyhO35386 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PhyhO35386 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PhyhO35386 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PhyhO35386 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PhyhO35386 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PhyhO35386 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PhyhO35386 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PhyhO35386 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PhyhO35386 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PhyhO35386 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PhyhO35386 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PhyhO35386 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PhyhO35386 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PhyhO35386 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PhyhO35386 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PhyhO35386 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PhyhO35386 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PhyhO35386 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PhyhO35386 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PhyhO35386 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PhyhO35386 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PhyhO35386 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PhyhO35386 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PhyhO35386 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PhyhO35386 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PhyhO35386 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PhyhO35386 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PhyhO35386 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PhyhO35386 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PhyhO35386 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PhyhO35386 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PhyhO35386 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PhyhO35386 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PhyhO35386 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PhyhO35386 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PhyhO35386 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PhyhO35386 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PhyhO35386 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PhyhO35386 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PhyhO35386 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PhyhO35386 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PhyhO35386 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PhyhO35386 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PhyhO35386 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PhyhO35386 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PhyhO35386 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PhyhO35386 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PhyhO35386 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhyhO35386 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhyhO35386 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PhyhO35386 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PhyhO35386 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PhyhO35386 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PhyhO35386 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PhyhO35386 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PhyhO35386 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PhyhO35386 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms