Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpaO35216 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpaO35216 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpaO35216 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpaO35216 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpaO35216 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpaO35216 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpaO35216 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpaO35216 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpaO35216 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpaO35216 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpaO35216 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpaO35216 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpaO35216 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpaO35216 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpaO35216 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpaO35216 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpaO35216 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpaO35216 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpaO35216 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpaO35216 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpaO35216 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpaO35216 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpaO35216 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpaO35216 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CenpaO35216 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpaO35216 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpaO35216 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpaO35216 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpaO35216 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpaO35216 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpaO35216 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpaO35216 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpaO35216 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpaO35216 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpaO35216 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpaO35216 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpaO35216 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpaO35216 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpaO35216 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpaO35216 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpaO35216 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpaO35216 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpaO35216 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpaO35216 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpaO35216 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpaO35216 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpaO35216 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpaO35216 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpaO35216 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpaO35216 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpaO35216 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpaO35216 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CenpaO35216 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpaO35216 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpaO35216 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpaO35216 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpaO35216 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpaO35216 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpaO35216 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpaO35216 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms