Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
CenpaO35216 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
CenpaO35216 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
CenpaO35216 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
CenpaO35216 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
CenpaO35216 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
CenpaO35216 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
CenpaO35216 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
CenpaO35216 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
CenpaO35216 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,02■■□□□ 1,6
CenpaO35216 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
CenpaO35216 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
CenpaO35216 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
CenpaO35216 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
CenpaO35216 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
CenpaO35216 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
CenpaO35216 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CenpaO35216 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
CenpaO35216 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CenpaO35216 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CenpaO35216 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
CenpaO35216 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
CenpaO35216 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
CenpaO35216 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
CenpaO35216 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
CenpaO35216 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
CenpaO35216 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
CenpaO35216 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
CenpaO35216 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
CenpaO35216 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
CenpaO35216 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
CenpaO35216 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
CenpaO35216 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
CenpaO35216 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
CenpaO35216 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
CenpaO35216 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
CenpaO35216 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
CenpaO35216 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
CenpaO35216 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
CenpaO35216 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
CenpaO35216 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
CenpaO35216 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
CenpaO35216 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
CenpaO35216 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
CenpaO35216 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
CenpaO35216 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
CenpaO35216 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
CenpaO35216 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
CenpaO35216 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
CenpaO35216 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
CenpaO35216 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
CenpaO35216 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
CenpaO35216 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
CenpaO35216 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,46
CenpaO35216 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
CenpaO35216 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
CenpaO35216 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
CenpaO35216 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
CenpaO35216 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,07■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
CenpaO35216 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
CenpaO35216 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,97■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
CenpaO35216 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23,97■■□□□ 1,43
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