Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Epha8O09127 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Epha8O09127 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Epha8O09127 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Epha8O09127 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Epha8O09127 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Epha8O09127 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Epha8O09127 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Epha8O09127 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Epha8O09127 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Epha8O09127 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Epha8O09127 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Epha8O09127 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Epha8O09127 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Epha8O09127 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Epha8O09127 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Epha8O09127 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Epha8O09127 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Epha8O09127 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Epha8O09127 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Epha8O09127 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Epha8O09127 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Epha8O09127 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Epha8O09127 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Epha8O09127 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Epha8O09127 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Epha8O09127 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Epha8O09127 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Epha8O09127 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Epha8O09127 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Epha8O09127 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Epha8O09127 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Epha8O09127 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Epha8O09127 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Epha8O09127 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Epha8O09127 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Epha8O09127 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Epha8O09127 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Epha8O09127 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Epha8O09127 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Epha8O09127 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Epha8O09127 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Epha8O09127 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Epha8O09127 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Epha8O09127 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Epha8O09127 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Epha8O09127 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Epha8O09127 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Epha8O09127 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Epha8O09127 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Epha8O09127 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Epha8O09127 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Epha8O09127 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Epha8O09127 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epha8O09127 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Epha8O09127 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Epha8O09127 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Epha8O09127 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Epha8O09127 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Epha8O09127 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Epha8O09127 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Epha8O09127 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Epha8O09127 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Epha8O09127 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Epha8O09127 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Epha8O09127 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Epha8O09127 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Epha8O09127 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Epha8O09127 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Epha8O09127 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Epha8O09127 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Epha8O09127 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epha8O09127 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Epha8O09127 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha8O09127 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha8O09127 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha8O09127 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epha8O09127 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Epha8O09127 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Epha8O09127 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Epha8O09127 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epha8O09127 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Epha8O09127 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Epha8O09127 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Epha8O09127 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Epha8O09127 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Epha8O09127 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Epha8O09127 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Epha8O09127 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Epha8O09127 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Epha8O09127 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Epha8O09127 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Epha8O09127 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms