Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
Casp6O08738 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Casp6O08738 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Casp6O08738 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Casp6O08738 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Casp6O08738 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Casp6O08738 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Casp6O08738 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Casp6O08738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Casp6O08738 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Casp6O08738 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Casp6O08738 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Casp6O08738 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Casp6O08738 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Casp6O08738 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Casp6O08738 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Casp6O08738 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Casp6O08738 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Casp6O08738 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Casp6O08738 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Casp6O08738 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Casp6O08738 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Casp6O08738 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Casp6O08738 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Casp6O08738 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Casp6O08738 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Casp6O08738 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Casp6O08738 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Casp6O08738 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Casp6O08738 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Casp6O08738 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Casp6O08738 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Casp6O08738 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Casp6O08738 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Casp6O08738 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Casp6O08738 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Casp6O08738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Casp6O08738 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Casp6O08738 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Casp6O08738 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Casp6O08738 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Casp6O08738 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Casp6O08738 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Casp6O08738 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Casp6O08738 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Casp6O08738 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Casp6O08738 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Casp6O08738 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Casp6O08738 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Casp6O08738 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Casp6O08738 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Casp6O08738 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Casp6O08738 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Casp6O08738 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Casp6O08738 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Casp6O08738 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Casp6O08738 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Casp6O08738 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Casp6O08738 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Casp6O08738 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Casp6O08738 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Casp6O08738 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Casp6O08738 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Casp6O08738 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Casp6O08738 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Casp6O08738 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,01■■□□□ 1,27
Casp6O08738 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Casp6O08738 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Casp6O08738 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Casp6O08738 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Casp6O08738 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Casp6O08738 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Casp6O08738 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Casp6O08738 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Casp6O08738 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Casp6O08738 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Casp6O08738 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Casp6O08738 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Casp6O08738 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Casp6O08738 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms