Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Speer4dL7N216 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Speer4dL7N216 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Speer4dL7N216 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Speer4dL7N216 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Speer4dL7N216 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Speer4dL7N216 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Speer4dL7N216 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Speer4dL7N216 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Speer4dL7N216 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Speer4dL7N216 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Speer4dL7N216 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,81■■■■□ 3
Speer4dL7N216 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Speer4dL7N216 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Speer4dL7N216 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Speer4dL7N216 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Speer4dL7N216 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Speer4dL7N216 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Speer4dL7N216 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Speer4dL7N216 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Speer4dL7N216 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Speer4dL7N216 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Speer4dL7N216 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Speer4dL7N216 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Speer4dL7N216 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Speer4dL7N216 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Speer4dL7N216 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Speer4dL7N216 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Speer4dL7N216 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Speer4dL7N216 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Speer4dL7N216 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Speer4dL7N216 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Speer4dL7N216 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Speer4dL7N216 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,2■■■□□ 2,91
Speer4dL7N216 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Speer4dL7N216 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Speer4dL7N216 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Speer4dL7N216 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Speer4dL7N216 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Speer4dL7N216 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Speer4dL7N216 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Speer4dL7N216 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Speer4dL7N216 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Speer4dL7N216 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Speer4dL7N216 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Speer4dL7N216 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Speer4dL7N216 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Speer4dL7N216 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Speer4dL7N216 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Speer4dL7N216 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Speer4dL7N216 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Speer4dL7N216 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Speer4dL7N216 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Speer4dL7N216 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Speer4dL7N216 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Speer4dL7N216 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Speer4dL7N216 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Speer4dL7N216 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Speer4dL7N216 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Speer4dL7N216 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Speer4dL7N216 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Speer4dL7N216 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Speer4dL7N216 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Speer4dL7N216 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Speer4dL7N216 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Speer4dL7N216 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Speer4dL7N216 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Speer4dL7N216 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Speer4dL7N216 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Speer4dL7N216 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Speer4dL7N216 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Speer4dL7N216 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Speer4dL7N216 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Speer4dL7N216 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Speer4dL7N216 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Speer4dL7N216 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Speer4dL7N216 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,25■■■□□ 2,75
Speer4dL7N216 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Speer4dL7N216 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,9 ms