Protein–RNA interactions for Protein: L7MTX3

1700020N15Rik, RIKEN cDNA 1700020N15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020N15RikL7MTX3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700020N15RikL7MTX3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700020N15RikL7MTX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700020N15RikL7MTX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700020N15RikL7MTX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700020N15RikL7MTX3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700020N15RikL7MTX3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700020N15RikL7MTX3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700020N15RikL7MTX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700020N15RikL7MTX3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700020N15RikL7MTX3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700020N15RikL7MTX3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700020N15RikL7MTX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700020N15RikL7MTX3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700020N15RikL7MTX3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700020N15RikL7MTX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700020N15RikL7MTX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700020N15RikL7MTX3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700020N15RikL7MTX3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700020N15RikL7MTX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700020N15RikL7MTX3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700020N15RikL7MTX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700020N15RikL7MTX3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700020N15RikL7MTX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700020N15RikL7MTX3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700020N15RikL7MTX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700020N15RikL7MTX3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700020N15RikL7MTX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700020N15RikL7MTX3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700020N15RikL7MTX3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700020N15RikL7MTX3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700020N15RikL7MTX3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms