Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
Ercc6F8VPZ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
Ercc6F8VPZ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
Ercc6F8VPZ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
Ercc6F8VPZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
Ercc6F8VPZ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
Ercc6F8VPZ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC50.63■■■■■ 5.7
Ercc6F8VPZ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
Ercc6F8VPZ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
Ercc6F8VPZ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
Ercc6F8VPZ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
Ercc6F8VPZ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC50.25■■■■■ 5.63
Ercc6F8VPZ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
Ercc6F8VPZ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
Ercc6F8VPZ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
Ercc6F8VPZ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
Ercc6F8VPZ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC50.17■■■■■ 5.62
Ercc6F8VPZ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC50.16■■■■■ 5.62
Ercc6F8VPZ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
Ercc6F8VPZ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
Ercc6F8VPZ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Ercc6F8VPZ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC50.05■■■■■ 5.6
Ercc6F8VPZ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Ercc6F8VPZ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
Ercc6F8VPZ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
Ercc6F8VPZ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC49.89■■■■■ 5.58
Ercc6F8VPZ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
Ercc6F8VPZ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
Ercc6F8VPZ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
Ercc6F8VPZ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
Ercc6F8VPZ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
Ercc6F8VPZ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
Ercc6F8VPZ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.66■■■■■ 5.54
Ercc6F8VPZ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC49.59■■■■■ 5.53
Ercc6F8VPZ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
Ercc6F8VPZ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC49.57■■■■■ 5.53
Ercc6F8VPZ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC49.54■■■■■ 5.52
Ercc6F8VPZ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
Ercc6F8VPZ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
Ercc6F8VPZ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
Ercc6F8VPZ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC49.36■■■■■ 5.49
Ercc6F8VPZ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
Ercc6F8VPZ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC49.3■■■■■ 5.48
Ercc6F8VPZ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC49.28■■■■■ 5.48
Ercc6F8VPZ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.23■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.2■■■■■ 5.47
Ercc6F8VPZ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
Ercc6F8VPZ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Ercc6F8VPZ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC49.11■■■■■ 5.45
Ercc6F8VPZ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
Ercc6F8VPZ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.07■■■■■ 5.45
Ercc6F8VPZ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
Ercc6F8VPZ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC49.05■■■■■ 5.44
Ercc6F8VPZ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
Ercc6F8VPZ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.41
Ercc6F8VPZ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
Ercc6F8VPZ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
Ercc6F8VPZ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
Ercc6F8VPZ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
Ercc6F8VPZ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
Ercc6F8VPZ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
Ercc6F8VPZ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC48.75■■■■■ 5.4
Ercc6F8VPZ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
Ercc6F8VPZ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Ercc6F8VPZ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
Ercc6F8VPZ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Ercc6F8VPZ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
Ercc6F8VPZ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
Ercc6F8VPZ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC48.65■■■■■ 5.38
Ercc6F8VPZ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
Ercc6F8VPZ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Ercc6F8VPZ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
Ercc6F8VPZ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Ercc6F8VPZ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
Ercc6F8VPZ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC48.53■■■■■ 5.36
Ercc6F8VPZ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
Ercc6F8VPZ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Ercc6F8VPZ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Ercc6F8VPZ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC48.49■■■■■ 5.35
Ercc6F8VPZ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
Ercc6F8VPZ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
Ercc6F8VPZ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC48.46■■■■■ 5.35
Ercc6F8VPZ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
Ercc6F8VPZ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ercc6F8VPZ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC48.38■■■■■ 5.34
Ercc6F8VPZ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Ercc6F8VPZ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Ercc6F8VPZ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Ercc6F8VPZ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Ercc6F8VPZ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Ercc6F8VPZ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
Ercc6F8VPZ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Ercc6F8VPZ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms