Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN4

Agl, Amylo-1,6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 1,532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AglF8VPN4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
AglF8VPN4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
AglF8VPN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43,39■■■■■ 4,54
AglF8VPN4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43,38■■■■■ 4,53
AglF8VPN4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
AglF8VPN4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
AglF8VPN4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
AglF8VPN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
AglF8VPN4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
AglF8VPN4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
AglF8VPN4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
AglF8VPN4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
AglF8VPN4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43,05■■■■■ 4,48
AglF8VPN4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
AglF8VPN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4,47
AglF8VPN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
AglF8VPN4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42,87■■■■■ 4,45
AglF8VPN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
AglF8VPN4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
AglF8VPN4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
AglF8VPN4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
AglF8VPN4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
AglF8VPN4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42,75■■■■■ 4,43
AglF8VPN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
AglF8VPN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42,74■■■■■ 4,43
AglF8VPN4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
AglF8VPN4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
AglF8VPN4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
AglF8VPN4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42,61■■■■■ 4,41
AglF8VPN4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
AglF8VPN4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42,57■■■■■ 4,41
AglF8VPN4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,54■■■■■ 4,4
AglF8VPN4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,39
AglF8VPN4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,48■■■■■ 4,39
AglF8VPN4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42,47■■■■■ 4,39
AglF8VPN4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42,46■■■■■ 4,39
AglF8VPN4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,38■■■■■ 4,38
AglF8VPN4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
AglF8VPN4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
AglF8VPN4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
AglF8VPN4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
AglF8VPN4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42,26■■■■■ 4,36
AglF8VPN4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
AglF8VPN4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42,15■■■■■ 4,34
AglF8VPN4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42,12■■■■■ 4,33
AglF8VPN4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
AglF8VPN4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
AglF8VPN4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42,05■■■■■ 4,32
AglF8VPN4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42,05■■■■■ 4,32
AglF8VPN4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
AglF8VPN4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC42,02■■■■■ 4,32
AglF8VPN4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,98■■■■■ 4,31
AglF8VPN4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,95■■■■■ 4,31
AglF8VPN4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41,95■■■■■ 4,31
AglF8VPN4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
AglF8VPN4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,92■■■■■ 4,3
AglF8VPN4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
AglF8VPN4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
AglF8VPN4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
AglF8VPN4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
AglF8VPN4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41,87■■■■■ 4,29
AglF8VPN4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
AglF8VPN4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,28
AglF8VPN4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC41,81■■■■■ 4,28
AglF8VPN4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
AglF8VPN4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
AglF8VPN4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
AglF8VPN4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
AglF8VPN4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41,68■■■■■ 4,26
AglF8VPN4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41,65■■■■■ 4,26
AglF8VPN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
AglF8VPN4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41,64■■■■■ 4,26
AglF8VPN4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41,63■■■■■ 4,26
AglF8VPN4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41,54■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41,53■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41,51■■■■■ 4,24
AglF8VPN4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
AglF8VPN4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
AglF8VPN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
AglF8VPN4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41,46■■■■■ 4,23
AglF8VPN4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41,46■■■■■ 4,23
AglF8VPN4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41,45■■■■■ 4,23
AglF8VPN4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
AglF8VPN4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
AglF8VPN4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
AglF8VPN4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
AglF8VPN4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
AglF8VPN4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41,33■■■■■ 4,21
AglF8VPN4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
AglF8VPN4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
AglF8VPN4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41,27■■■■■ 4,2
AglF8VPN4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
AglF8VPN4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
AglF8VPN4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
AglF8VPN4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41,2■■■■■ 4,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms