Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8005F6YKY3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8005F6YKY3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8005F6YKY3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8005F6YKY3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8005F6YKY3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8005F6YKY3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8005F6YKY3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8005F6YKY3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8005F6YKY3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8005F6YKY3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8005F6YKY3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8005F6YKY3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8005F6YKY3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8005F6YKY3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8005F6YKY3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8005F6YKY3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8005F6YKY3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8005F6YKY3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8005F6YKY3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8005F6YKY3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8005F6YKY3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8005F6YKY3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8005F6YKY3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8005F6YKY3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8005F6YKY3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8005F6YKY3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8005F6YKY3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8005F6YKY3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8005F6YKY3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8005F6YKY3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8005F6YKY3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8005F6YKY3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8005F6YKY3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8005F6YKY3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8005F6YKY3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8005F6YKY3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8005F6YKY3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8005F6YKY3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8005F6YKY3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8005F6YKY3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8005F6YKY3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8005F6YKY3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8005F6YKY3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8005F6YKY3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8005F6YKY3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8005F6YKY3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8005F6YKY3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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