Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44,36■■■■■ 4,69
Erich3F6QRE9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44,34■■■■■ 4,69
Erich3F6QRE9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,68
Erich3F6QRE9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,25■■■■■ 4,67
Erich3F6QRE9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,22■■■■■ 4,67
Erich3F6QRE9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Erich3F6QRE9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Erich3F6QRE9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44,06■■■■■ 4,64
Erich3F6QRE9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Erich3F6QRE9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,97■■■■■ 4,63
Erich3F6QRE9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,96■■■■■ 4,63
Erich3F6QRE9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,9■■■■■ 4,62
Erich3F6QRE9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Erich3F6QRE9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,8■■■■■ 4,6
Erich3F6QRE9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Erich3F6QRE9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,76■■■■■ 4,6
Erich3F6QRE9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,65■■■■■ 4,58
Erich3F6QRE9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43,63■■■■■ 4,58
Erich3F6QRE9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,61■■■■■ 4,57
Erich3F6QRE9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Erich3F6QRE9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Erich3F6QRE9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Erich3F6QRE9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,43■■■■■ 4,54
Erich3F6QRE9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
Erich3F6QRE9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
Erich3F6QRE9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Erich3F6QRE9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Erich3F6QRE9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43,35■■■■■ 4,53
Erich3F6QRE9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
Erich3F6QRE9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,33■■■■■ 4,53
Erich3F6QRE9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43,3■■■■■ 4,52
Erich3F6QRE9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Erich3F6QRE9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
Erich3F6QRE9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43,22■■■■■ 4,51
Erich3F6QRE9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Erich3F6QRE9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Erich3F6QRE9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43,19■■■■■ 4,51
Erich3F6QRE9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Erich3F6QRE9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43,17■■■■■ 4,5
Erich3F6QRE9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43,13■■■■■ 4,49
Erich3F6QRE9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Erich3F6QRE9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Erich3F6QRE9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Erich3F6QRE9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43,01■■■■■ 4,48
Erich3F6QRE9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Erich3F6QRE9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42,95■■■■■ 4,47
Erich3F6QRE9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Erich3F6QRE9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Erich3F6QRE9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Erich3F6QRE9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Erich3F6QRE9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Erich3F6QRE9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42,79■■■■■ 4,44
Erich3F6QRE9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Erich3F6QRE9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Erich3F6QRE9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42,68■■■■■ 4,42
Erich3F6QRE9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,67■■■■■ 4,42
Erich3F6QRE9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
Erich3F6QRE9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Erich3F6QRE9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Erich3F6QRE9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,54■■■■■ 4,4
Erich3F6QRE9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,46■■■■■ 4,39
Erich3F6QRE9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
Erich3F6QRE9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Erich3F6QRE9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Erich3F6QRE9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Erich3F6QRE9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42,4■■■■■ 4,38
Erich3F6QRE9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Erich3F6QRE9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,36
Erich3F6QRE9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
Erich3F6QRE9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
Erich3F6QRE9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Erich3F6QRE9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Erich3F6QRE9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Erich3F6QRE9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,18■■■■■ 4,34
Erich3F6QRE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Erich3F6QRE9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Erich3F6QRE9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Erich3F6QRE9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Erich3F6QRE9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,11■■■■■ 4,33
Erich3F6QRE9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Erich3F6QRE9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
Erich3F6QRE9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
Erich3F6QRE9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42,01■■■■■ 4,32
Erich3F6QRE9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42■■■■■ 4,31
Erich3F6QRE9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41,99■■■■■ 4,31
Erich3F6QRE9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Erich3F6QRE9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Erich3F6QRE9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41,93■■■■■ 4,3
Erich3F6QRE9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
Erich3F6QRE9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
Erich3F6QRE9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41,9■■■■■ 4,3
Erich3F6QRE9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Erich3F6QRE9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Erich3F6QRE9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
Erich3F6QRE9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41,87■■■■■ 4,29
Erich3F6QRE9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41,82■■■■■ 4,29
Erich3F6QRE9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Erich3F6QRE9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Erich3F6QRE9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,77■■■■■ 4,28
Erich3F6QRE9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41,74■■■■■ 4,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms